2021 m. pradžioje Kolumbijos mokslininkai atrado nerimą keliantį naujo tipo koronavirusą. Šis variantas, galiausiai žinomas kaip Mu, turėjo keletą nerimą keliančių mutacijų, kurios, ekspertų nuomone, gali padėti išvengti imuninės sistemos apsaugos.

Per kitus mėnesius Mo sparčiai plito Kolumbijoje, Skatina naują Covid-19 atvejų bangą. Iki rugpjūčio pabaigos jis buvo aptiktas dešimtyse šalių ir Pasaulio sveikatos organizacijos ją paskyrė „Susidomėjęs kintamasis“.

Josephas Foferis, Nebraskos universiteto medicinos centro genetinis epidemiologas ir autorius Neseniai atliktas kintamojo tyrimas.

Tada dingo. Šiandien variantas visiškai išnykęs.

už Delta arba Omikronas Yra gama, iota arba mu variantai, kurie sukėlė vietinius protrūkius, bet niekada nepanaikino pasaulinio dominavimo. Ir nors supratimas, kad „Omicron“ tebėra svarbus visuomenės sveikatos prioritetas, iš šių mažiau padermių galima pasimokyti, sako ekspertai.

„Šis virusas neturi paskatų sustabdyti prisitaikymą ir evoliuciją“, – sakė Kalifornijos universiteto San Diego molekulinis epidemiologas Joelis Werthemas. „Ir žinojimas, kaip tai padarėte praeityje, padės mums pasiruošti tam, ką galite padaryti ateityje.”

Stebėjimo tyrimai taip pat atskleidžia priežiūros spragas ir politikos klaidas – pateikia daugiau įrodymų, kad tarptautinis draudimas keliauti Amerikoje nebuvo veiksmingas – ir tai, kas skatina virusą veikti, o tai rodo, kad ankstyvoje pandemijos stadijoje užkrečiamumas buvo svarbesnis nei imunitetas. išsisukinėjimą.

Tyrimas taip pat pabrėžia konteksto svarbą; Kintamieji, kurie turi įtakos kai kuriose vietose, neįgyja atramos kitur. Dėl to sunku numatyti, kurie kintamieji taps dominuojantys, o norint neatsilikti nuo būsimų kintamųjų ir patogenų, reikės atlikti visapusišką stebėjimą beveik realiu laiku.

„Mes galime daug laimėti pažvelgę ​​į viruso genomo seką ir sakydami: „Vienas tikriausiai yra blogesnis už kitą“, – sakė dr. Werthem.

Čia matosi Mu

The Koronavirusas Ji nuolat keičiasi, o dauguma naujų variantų lieka nepastebėti arba įvardijami. Tačiau kiti skambina pavojaus varpais dėl to, kad jie greitai tampa vis dažnesni, arba dėl to, kad jų genomai atrodo grėsmingi.

Abu buvo teisingi Mo, kai jis išplito į Kolumbiją. „Jame buvo keletas mutacijų, kurias žmonės atidžiai stebėjo“, – sakė Marie Petron, Sidnėjaus universiteto genetinė epidemiologė ir naujojo Moe straipsnio autorė. Kituose imunologiniuose variantuose, įskaitant beta ir gama, buvo užfiksuotos kelios smailių baltymų mutacijos.

Naujajame tyrime, kuris dar nebuvo paskelbtas moksliniame žurnale, mokslininkai palygino Mu biologines savybes su alfa, beta, delta, gama ir pirminio viruso savybėmis. Jie nustatė, kad Mu nesidaugino greičiau nei bet kuris kitas variantas, tačiau jis buvo labiausiai atsparus imunitetui – atsparesnis antikūnams nei bet kuris žinomas variantas, išskyrus Omicroną.

Analizuodami iš viso pasaulio surinktų Mu mėginių genomines sekas, mokslininkai atkūrė varianto paplitimą. Jie padarė išvadą, kad Mu greičiausiai pasirodė Pietų Amerikoje 2020 m. viduryje. Tada jis buvo platinamas keletą mėnesių, kol buvo atrastas.

Jis sakė, kad genomo stebėjimas daugelyje Pietų Amerikos dalių buvo „neišsamus ir neišsamus“. Jesse Bloom, Fredo Hutchinsono vėžio tyrimų centro Sietle virusų evoliucijos ekspertas. „Jei tose srityse būtų buvęs geresnis stebėjimas, galbūt būtų buvę lengviau greitai įvertinti, kaip susirūpinęs Mo.

Mo pateikė ir dar vieną iššūkį. Ji turėjo tam tikro tipo mutaciją, vadinamą kadrų poslinkio mutacija, kuri buvo reta koronaviruso mėginiuose. Šios mutacijos buvo pažymėtos kaip klaidos, kai mokslininkai, įskaitant daktarą Foferį, bandė įkelti savo Mu sekas į GISAIDAStarptautinė virusų genomų saugykla, naudojama naujiems variantams stebėti.

Dėl šios komplikacijos buvo vėluojama dalyvauti Mo sekose. Tyrėjai nustatė, kad laikas nuo viruso mėginio paėmimo iš paciento ir paskelbimo GISAID atveju visada buvo ilgesnis Mu atvejų nei Delta atvejų.

„Pats genomas iš esmės sukūrė dirbtines priežiūros spragas“, – sakė daktaras Fauferis. „Tai lėmė, bent jau mūsų patirtimi, kad mes neturime duomenų kelias savaites, kai paprastai bandome juos paskelbti per kelias dienas.

(Tyrėjai pabrėžė GISAID kokybės kontrolės sistemų svarbą, o saugykla išsprendė problemą.)

Sujungus šias stebėjimo spragas su Mu imuninės sistemos vengimu, atrodė, kad alternatyva netrukus pakils. Bet atsitiko ne taip. Vietoj to, mokslininkai nustatė, kad Mo išplito iš Pietų ir Centrinės Amerikos į kitus žemynus, tačiau ten patekęs nebuvo plačiai paplitęs. „Tai buvo požymis, kad šis variantas nebūtinai buvo toks tinkamas galbūt Šiaurės Amerikos ir Europos populiacijoms, kaip tikėjomės“, – sakė daktaras Petronas.

Greičiausiai taip buvo todėl, kad Mu konkuravo su dar nuostabesniu variantu: delta. Delta nebuvo taip įgudęs išvengti antikūnų kaip Mu, bet buvo labiau perduodamas. „Taigi galiausiai Delta išplito plačiau“, – sakė daktaras Bloomas.

Teisingas pasirinkimas, tinkamas laikas

Sėkmingų variantų studijavimas atskleidžia tik pusę istorijos. „Kintamieji, kurie netampa dominuojančiais, tam tikra prasme yra neigiamos kontrolės priemonės“, – sakė daktaras Petronas. „Jie mums pasakoja, kas neveikė, ir tai darydami padeda užpildyti žinių apie kintamą kūno rengybą spragas.

Delta pranoko kelis imunogeninius variantus, be Mu, įskaitant Beta, Gamma ir Lambda. Šis modelis rodo, kad vien imuniteto vengimo nepakako, kad variantas išaugtų už labai užkrečiamą viruso versiją – arba bent jau to nebuvo ankstyvoje epidemijos fazėje, kai imunitetą turėjo nedaug žmonių.

Tačiau vakcinacijos ir daugybė infekcijų bangų pakeitė imuninę sistemą. Mokslininkai teigė, kad labai atspari alternatyva dabar turėtų turėti daugiau pranašumų, o tai greičiausiai yra dalis „Omicron“ sėkmės priežasties.

Kitas neseniai atliktas tyrimas parodė, kad imunitetas vengia gama Niujorke Linkęs daryti geriau Kai kuriais atvejais rajonuose, kuriuose imunitetas buvo aukštesnis, kai kuriais atvejais dėl to, kad jie smarkiai nukentėjo nuo pirmosios Covid bangos. „Negalime matyti naujo kintamojo vakuume, nes jis yra visų prieš tai buvusių kintamųjų šešėlyje“, – sakė tyrimo autorius daktaras Werthem.

Iš tiesų, kintamųjų susidūrimas praeityje atskleidžia, kad sėkmė labai priklauso nuo konteksto. Pavyzdžiui, Niujorkas galėjo būti Iota varianto gimtinė, kuri Jis buvo atrastas pirmą kartą 2020 m. lapkritį paimtuose viruso mėginiuose. „Taigi jis anksti įsitvirtino“, – sakė daktaras Petronas. Net ir pasirodžius nešiojamesniam Alpha variantui, Iota keletą mėnesių išliko dominuojančiu variantu mieste, kol galiausiai išnyko.

Tačiau Konektikute, kur Iota ir Alpha debiutavo 2021 m. sausį, viskas klostėsi kitaip. „Alfa iš karto pakilo, IOTA neturėjo jokių šansų“, – sakė operacijai vadovavęs daktaras Petronis. Ištirkite kintamuosius dviejuose regionuose.

Panašus modelis jau pradeda ryškėti naudojant daugybę Omicron padermių. Jungtinėse Valstijose BA.2.12.1, variantas, pirmą kartą nustatytas Niujorke, nusiėmėBūdamas Pietų Afrikoje, BA.4 ir BA.5 skatina naują bumą.

Tai dar viena priežastis tirti sumažėjusius variantus, sakė Britų Kolumbijos universiteto evoliucijos biologė Sarah Otto. Alternatyva, kuri nebuvo gerai suderinta su konkrečiu laiku ir vieta, galėtų pakilti kitur. Tiesą sakant, tikriausiai Mo nelaimė, kad jis pasirodė taip anksti. „Gal nebuvo pakankamai imunitetą turinčių žmonių, kad būtų galima paskatinti šį variantą“, Daktaras Otto pasakė.

Tačiau kitas nerimą keliantis variantas gali būti imuninės sistemos vengiančios padermės palikuonis ar kažkas panašaus, kuri niekada nepasitvirtino, sakė ji.

Žvelgiant į ankstesnius kintamuosius galima suprasti, kas veikė arba neveikė, kad juos būtų galima įtraukti. Naujasis Gama tyrimas pateikia papildomų įrodymų Tarptautinių kelionių draudimasbent jau taip, kaip įgyvendino Jungtinės Valstijos, vargu ar užkirs kelią pasauliniam varianto plitimui.

Gama pirmą kartą buvo pripažinta Brazilijoje 2020 m. pabaigoje. Tų metų gegužės mėn. Jungtinės Valstijos uždraudė daugumai ne JAV piliečių keliauti į šalį iš Brazilijos – apribojimas tebegalioja Iki 2021 m. lapkričio mėn. Tačiau gama buvo atrasta Jungtinėse Valstijose 2021 m. sausį ir netrukus išplito į dešimtis šalių.

Kadangi gama niekada iš tikrųjų nedominavo visame pasaulyje, jos paplitimo tyrimas suteikia „švaresnį“ kelionių draudimo veiksmingumo vaizdą, sakė Kalifornijos San Diego universiteto molekulinė epidemiologė ir tyrimo autorė Titiana Vasiljeva. „Kalbant apie kintamųjų, tokių kaip delta, tyrimą – tai, kas visur sukelia didžiulius protrūkius – kartais labai sunku rasti modelius, nes tai vyksta labai dideliu mastu ir labai greitai“, – sakė ji.

Daktaras Fauferis sakė, kad vykstant pasaulinei sveikatos krizei ir greitai besikeičiančiam virusui, yra suprantama priežastis sutelkti dėmesį į ateitį. Kai pasaulio dėmesys nukrypo į Deltą, o vėliau ir į Omicroną, jis ir jo kolegos svarstė, ar tęsti senų naujienų Mu tyrimą.

prisimena dr. „Tačiau manome, kad vis dar yra vietos aukštos kokybės tyrimams, kuriuose užduodami klausimai apie jau egzistuojančius susirūpinimą keliančius kintamuosius ir bandoma persvarstyti, kas atsitiko.