DNR atskleidžia didžiausią visų laikų žmogaus šeimos medį, datuojamą 100 000 metų

Tyrimas, kuriam vadovavo Oksfordo universiteto Didžiųjų duomenų instituto mokslininkai, sujungia žmogaus genomus iš įvairių šaltinių – tiek senovės, tiek šiuolaikinių DNR – siekiant geriau suprasti žmonijos istoriją ir raidą.

Kaip šeimos medis parodo, kaip asmuo yra susijęs su savo tėvais ar broliais ir seserimis, jis yra paveldimas Pagrindinis autorius Anthony Wilderis Wonsas, dabar MIT ir Harvardo Plačiojo instituto mokslo darbuotojas, CNN sakė, kad genealogija atskleidžia genus, kuriuos turi du žmonės.

Tokiu būdu jis gali parodyti, kurie žmogaus genomo taškai dalijasi genais ir kur jie skiriasi.

„Paprasčiau tariant, mes sukūrėme didžiausią visų laikų žmonių šeimos medį“, – sakė Wonsas. „Turime vieną giminę, kuri atseka visos žmonijos protėvius ir parodo, kaip šiandien visi esame susiję vienas su kitu“.

Išteklius reiškia, kad kiekvienas, turintis prieigą prie savo genetinės informacijos, gali sužinoti, kada jų protėviai persikėlė į tam tikrą vietą ir kodėl jie turi tam tikrus genus.

„Iš esmės tai supranta visą žmonijos istorijos istoriją, įrašytą mūsų genuose“, – sakė Wohnsas.

Žmogaus genetiniai tyrimai pastaraisiais dešimtmečiais sparčiai vystėsi, generuodami didžiulius kiekius naujos informacijos. Nauji senovės DNR analizės metodai suteikė viliojančių detalių apie priešistorinius laikus ir 2010 m. Žmonės susituokė su neandertaliečiais.

Tačiau pasirodė, kad sunku sujungti skirtingas duomenų bazes, sujungti senovės ir šiuolaikinius genomus ir rasti būdų, kaip susidoroti su tokiu dideliu duomenų kiekiu.

Oksfordo komanda sukūrė algoritmus, leidžiančius į savo įrankį įtraukti genomą.

„Tai buvo viena didžiausių mūsų naujovių“, – sakė Wonsas.

Tai, pasak jo, leido jiems sukurti struktūrą, vadinamą „žmogaus genetine genealogija“, apie kurią teoriškai buvo kalbama beveik 30 metų.

„Iš esmės bandome prasibrauti pro šydą ir pamatyti, kaip tai atrodo“, – pridūrė jis.

READ  „Omicron“ kintamieji simptomai: 5 simptomai, kurių neturėtumėte ignoruoti

Šiuo metu 3 609 žmonių genai buvo suskirstyti iš 215 grupių, kai kurios datuojamos daugiau nei 100 000 metų. Šis metodas leidžia ateityje išplėsti šį skaičių iki milijonų genomų.

Straipsnyje patvirtinamos dabartinės išvados apie žmonijos istoriją, įskaitant tai, kad dauguma žmonių evoliucijos įvyko Afrikoje anksčiau didelis Wohnsas teigė, kad judėjimas už žemyno įvyko maždaug prieš 70 000 metų.

Naujas tyrimas parodė, kad identiški dvyniai ne visada yra genetiškai identiški

„Tai patvirtina daugeliu atžvilgių“, – sakė jis ir pridūrė, kad duomenys rodo, kad Afrikoje yra didžiausia genetinė įvairovė ir kad seniausi žmonių protėviai yra šiame žemyne. „Akivaizdu, kad didžioji žmogaus evoliucijos dalis įvyko Afrikoje.

Genetinės genealogijos „Pirmasis juodraštis“.

Tačiau duomenys taip pat kelia klausimų.

„Tai rodo nežinomas migracijas, kurios įvyko praeityje“, – sakė Wonsas.

Pavyzdžiui, yra tam tikrų įrodymų, kad žmonių protėviai Šiaurės Amerikoje buvo anksčiau, nei manyta anksčiau, nors reikia daugiau tyrimų, kad būtų atskleistos nežinomos migracijos, sakė jis.

Wensas palygino tyrimą su „pirmuoju žmogaus genetinės genealogijos juodraščiu“ ir teigė, kad daugiau darbo padės padaryti jį tikslesnį ir išsamesnį.

Pridėjus daugiau genomų, tai padės padaryti, bet norėdami pasiekti visišką tikslumą, turime gauti kiekvieno kada nors gyvenusio žmogaus genomą, sakė jis, o tai neįmanoma.

Tyrimas teigia, kad įprasti genetiniai tyrimai dažnai yra klaidingi nustatant retas ligas sukeliančius variantus, tokius kaip BRCA1 ir BRCA2.

Wohnsas teigė, kad tikisi, kad kiti šios srities tyrinėtojai naudos išteklius, kuriuos galima atsisiųsti kartu su naudojimo instrukcijomis, kaip pagrindą atsakydami į konkretesnius klausimus apie migraciją tam tikrose geografinėse srityse.

„Tai bus tikrai turtingas šaltinis būsimiems žmogaus evoliucijos istorijos tyrimams“, – sakė jis.

Pats Wonsas dirba su AI tyrėjais, siekdamas gauti tikslesnius įvertinimus, kada ir kur gyveno žmonių protėviai.

Šis metodas taip pat gali būti naudojamas kuriant bet kurio organizmo genealogiją, įskaitant tokias ligas kaip SARS-CoV-2, koronavirusą, sukeliantį Covid-19, ir Wohnsas planuoja ištirti genetikos ir ligos ryšį.

Laikraštis buvo išspausdintas ketvirtadienį žurnale žinoti.

Evoliucijos studijų „didysis pažadas“.

Franciso Cricko instituto Londone evoliucinės genomikos mokslų daktaras Andersas Bergstromas CNN sakė, kad šis tyrimas suteikia naują būdą įvertinti mūsų DNR ryšį.

READ  Išgirskite melodingą supermasyvios juodosios skylės dainavimą Paukščių Take... pabuskite...

„Išvesti į medžius panašias linijas, jungiančias skirtingų žmonių DNR, yra šventasis genomikos gralis. Tai niekada nebus iki galo išspręsta, tačiau šis naujas skaičiavimo metodas žengia svarbų žingsnį į priekį sprendžiant šią problemą”, – sakė jis el.

„Jų išvestinė genealogija suteikia neįtikėtinai turtingą įžvalgą apie žmogaus genetinę įvairovę ir istoriją. Šiuo metu genomikos srityje yra daug įspūdžių dėl daugybės galimybių, kurias siūlo šie nauji skaičiavimo metodai.”

Franciso Cricko instituto Senovės genomo laboratorijos grupės vadovas Pontusas Skoglundas CNN sakė, kad tyrimas rodo, kad toks požiūris gali būti taikomas didelėms duomenų bazėms.

„Todėl jie žada daug naudos medicinos genetikai ir evoliucijos tyrimams, o šis dokumentas yra didžiulis žingsnis į priekį to link”, – elektroniniu paštu sakė Skoglundas.

Parašykite komentarą

El. pašto adresas nebus skelbiamas. Būtini laukeliai pažymėti *