Rusijos mokslininkų komanda atskleidė naujų ir pavojingų koronaviruso atmainų, tokių kaip Alfa, Delta, Omicron ir kt., atsiradimo mechanizmus.

Komanda, vadovaujama Nacionalinio tyrimų universiteto aukštosios ekonomikos mokyklos (HSE) narių, išsiaiškino, kad pakeitimo tikimybė tam tikroje SARS-CoV-2 genomo vietoje priklauso nuo suderinamų pakaitalų kitose vietose.

Tai paaiškina, kodėl netikėtai atsirado nauji ir labiau užkrečiami viruso variantai, kurie labai skiriasi nuo anksčiau platintų, rašoma žurnale „eLife“ paskelbtame straipsnyje.

Visi virusai laikui bėgant keičiasi, įskaitant SARS-CoV-2 virusą, atsakingą už koronaviruso pandemiją. Kuo ilgiau virusas cirkuliuoja populiacijoje ir kuo daugiau juo užsikrėtusių individų, tuo daugiau pakitimų (mutacijų) jis sukaupia. Paprastai naujos viruso padermės yra panašios į jų tėvų padermes.

Tačiau kai kuriais atvejais dėl mutacijų gali atsirasti variantų, kurie geriau prisitaiko prie aplinkos ir kelia didesnį pavojų žmonių sveikatai. Šie variantai linkę plisti greičiau, gali nereaguoti į dabartines vakcinas ar gydymą ir juos gali būti sunkiau diagnozuoti.

„Viruso evoliuciją bendruomenėje galima palyginti su kelione per didžiulę reljefą su slėniais, tarpekliais ir kalvomis. Virusas atsitiktinai klaidžioja per tą kraštovaizdį, greitai miršta, jei patenka į ertmę, ir ilgiau gyvena slėniuose. “ – sakė Aleksejus Neverovas iš HSE Tarptautinės statistinės genomikos laboratorijos. Ir buhalteris:

Tyrimo metu komanda išanalizavo daugiau nei tris milijonus skirtingų SARS-CoV-2 padermių genomo sekų. Jie nustatė konkrečias vietas koronaviruso baltymų paviršiuje, kur įvyko aminorūgščių pakaitalai, išskirdami variantus tiek nuo pradinės Wuhan padermės, tiek vienas nuo kito.

Atrodo, kad daugelis iš šių vietų vystosi vienodai, todėl aminorūgščių pokyčiai vienoje vietoje greitai atsiranda ir kitoje. Visi aktyvūs ir virulentiški viruso variantai buvo atskirti nuo anksčiau dominavusių variantų pagal kelių pakaitų modelius.

„Asmenys, sergantys ilgalaikiu COVID-19, gali turėti daug variantų, kurie nėra gerai pritaikyti išgyventi bendrojoje populiacijoje. Tačiau laikui bėgant šie variantai gali išsivystyti į stipresnes formas, kurios gali plačiai išplisti ir įsiveržti. Pasaulis Neverovas paaiškino.

Komanda siūlo paaiškinimą, kodėl neatsiranda tarpinių variantų, kurie skiriasi nuo pradinio viruso tik vienu ar dviem pakaitalais. Gali būti, kad šie „silpni“ variantai tampa „stipriais“ tik tada, kai sujungiate visą individualiai žalingų pakaitalų modelį. Dėl to, pasak mokslininkų, sunku numatyti naujos, labai prisitaikančios padermės atsiradimą.

Tyrimo autorių naudojamas statistinis metodas yra universalus ir gali būti naudojamas daugelio kitų patogenų evoliucijai tirti. Visų pirma, šis metodas buvo sėkmingai pritaikytas tiriant gripo ir tuberkuliozės vystymąsi.