Redaktoriui:

Pastaraisiais mėnesiais omikronas (B.1.1.529) tapo dominuojančiu sunkaus ūminio kvėpavimo sindromo koronaviruso 2 (SARS-CoV-2) variantu, rodančiu tam tikrą imuninės sistemos vengimo laipsnį.¹ Pirminius omikrono subvariantus BA.1 ir BA.2 daugelyje šalių palaipsniui išstumia BA.5, galbūt dėl ​​BA.1 ir BA.2 sukelto padidėjusio užkrečiamumo ir dalinio imuniteto vengimo.^2,3 BA.1 teikiama apsauga nuo BA.5 pokintamojo sukeltos infekcijos yra labai svarbi, nes klinikinių tyrimų metu pritaikytos vakcinos yra pagrįstos BA.1.

Portugalija buvo viena iš pirmųjų šalių, kurią paveikė BA.5 dominavimas. Naudojome Nacionalinį 2019 m. koronavirusinės ligos (Covid-19) registrą (SINAVE), norėdami apskaičiuoti BA.5 infekcijos riziką tarp tiriamųjų, kuriems buvo dokumentuota infekcija su ankstesniais variantais, įskaitant BA.1 ir BA.2. Į registrą įtraukiami visi šalyje užregistruoti atvejai, neatsižvelgiant į klinikinį vaizdą.

Figūra 1. Figūra 1. Apsauginis ankstesnės SARS-CoV-2 infekcijos poveikis infekcijai Omicron BA.5 variantu.

Kaip parodyta a skydelyje, mes nustatėme laikotarpius (skirtingomis spalvomis), kai vienas variantas buvo atstovaujamas daugiau nei 90% mėginių izoliatų (duomenys iš nacionalinio sunkaus ūminio kvėpavimo sindromo koronaviruso 2). [SARS-CoV-2] genetinės įvairovės kontrolė⁴). Pilki taškai reiškia laikus, kai apyvartoje buvo daugiau nei vienas kintamasis. Atsižvelgiant į santykinai lėtą perėjimą tarp omikroninio BA.1 varianto dominavimo ir omikroninio BA.2 varianto dominavimo, analizėje sujungėme BA.1 ir BA.2. Mes neįtraukėme jokių tiriamųjų, užsikrėtusių per 90 dienų iki omikroninio BA.5 subfaktoriaus dominavimo. B skydelyje parodytas apsaugos nuo infekcijos veiksmingumas BA.5 kontroliniu laikotarpiu (nuo 2022 m. birželio 1 d.) tarp tiriamųjų, sergančių viena infekcija skirtingų variantų dominavimo laikotarpiais, kaip parodyta A skydelyje, palyginti su tiriamaisiais, kuriems nebuvo dokumentuota. infekcija nuo birželio 1 d. Žmonės, užsikrėtę infekcija iki birželio 1 d., į tyrimą nebuvo įtraukti. 👉 Juostos rodo 95 % pasikliautinuosius intervalus.

Nacionalinė SARS-CoV-2 genetinė priežiūra nustatė laikotarpius, kai skirtingi variantai sudaro daugiau nei 90 % izoliatų.⁴ Mes nustatėme visus tiriamuosius, kurie pirmą kartą užsikrėtė kontroliniais laikotarpiais kiekvienam kintamajam, kad apskaičiuotume jų infekcijos riziką BA.5 kontrolinio laikotarpio metu (1a pav). Sujungėme BA.1 ir BA.2, nes populiacijoje lėtas perėjimas tarp dviejų subkintamųjų. Galiausiai apskaičiavome BA.5 riziką populiacijai, kuri iki BA.5 dominavimo (2022 m. birželio 1 d.) neturėjo dokumentais patvirtintos infekcijos.

Mes nustatėme, kad ankstesnė SARS-CoV-2 infekcija turėjo apsauginį poveikį nuo BA.5 infekcijos (1b pav ir S1 lentelę papildomame priede, kurią galima rasti su visu šio laiško tekstu adresu NEJM.org), ir ši apsauga buvo maksimali ankstesnei infekcijai BA.1 arba BA.2. Šie duomenys turėtų būti vertinami atsižvelgiant į labai vakcinuotų populiacijų įsiskverbimo infekciją, atsižvelgiant į tai, kad daugiau nei 98 % tiriamosios Portugalijos gyventojų pirminės vakcinacijos seriją baigė iki 2022 m.

Tyrimo planas negali pašalinti visų painiavos (žr. papildomo priedo diskusijų skyrių). Be to, vienas apribojimas yra numanomas sumažėjusio imuniteto poveikis populiacijai, turinčiai heterozigotinį imunitetą (ankstesnė infekcija ir vakcinacija). Mes nustatėme, kad BA.1 arba BA.2 infekcija vakcinuotiems asmenims suteikė didesnę apsaugą nuo BA.5 nei infekcija prieš omikroninius variantus, o tai atitinka naujausią ataskaitą apie neigiamą testo planą.⁵ Tačiau BA.1 arba BA.2 infekcijos pasireiškė arčiau BA.5 dominavimo laikotarpio nei infekcijos su ankstesniais variantais. Yra nuomonė, kad apsauga, kurią suteikia ankstesnė infekcija BA.1 arba BA.2, yra labai žema, atsižvelgiant į didelį BA.5 infekcijų skaičių tarp asmenų, anksčiau užsikrėtusių BA.1 arba BA.2 virusu. Mūsų duomenys rodo, kad šis suvokimas tikriausiai yra didesnės grupės tiriamųjų, sergančių BA.1 arba BA.2 infekcija, rezultatas, palyginti su infekcija, kurią sukėlė kiti subkintamieji, ir jo nepatvirtina duomenys.

Apskritai, mes nustatėme, kad BA.5 varianto infekcijos prasiskverbimo tikimybė buvo mažesnė tarp žmonių, anksčiau sirgusių SARS-CoV-2 labai vakcinuotų žmonių populiacijoje, ypač nuo ankstesnių BA.1 arba BA.2 infekcijų, nei tarp neinfekuotų asmenų. .. .

Joao Malato, MA.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lisabona, Portugalija

Roy M. Ribeiro, Philas D.
Los Alamos nacionalinė laboratorija, Los Alamos, Naujoji Meksika

Pedro P. Leite, MD
Pedro Casaca, MD
Eugenia Fernandez, mokslų daktarė
Direção Geral da Saúde, Lisabona, Portugalija

Carlosas Antunesas, mokslų daktaras
Lisabonos universitetas, Lisabona, Portugalija

Válter R. Fonseca, MD, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Lisabona, Portugalija

Manuelis C. Gomezas, mokslų daktaras.
Lisabonos universitetas, Lisabona, Portugalija

Luisas Graca, MD, Philas D.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lisabona, Portugalija
[email protected]

Šis pranešimas buvo paskelbtas 2022 m. rugpjūčio 31 d. adresu NEJM.org.